رهبرجنایتکار جمهوری اسلامی با همه‌پرسی و مراجعه به آرای مردم صریحا مخالفت کرد و گفت “مسائل مختلف کشور قابل رفراندم نیست.” بسیاری از چهره‌های سیاسی، مدنی و مسئولان پیشین خواستار برگزاری رفرندام برای تغییر وضع موجود هستند.
علی خامنه‌ای، رهبر جمهوری اسلامی، روز سه‌شنبه ۲۹ فروردین در سخنرانی برای جمعی از دانشجویان مخالفت خود را با برگزاری هرگونه رفراندم اعلام کرد. او گفت: «مسائل مختلف کشور قابل رفراندوم نیست؛ زیرا هر رفراندوم ۶ ماه همه کشور را درگیر می‌کند. ضمن اینکه در کجای دنیا برای همه مسائل رفراندوم برگزار می‌کنند؟»
به گزارش ایسنا اظهارات خامنه‌ای در واکنش به سخنان دانشجویی بیان شد که گفته بود: «باید از روز اول درباره مسائل مختلف رفراندوم برگزار می‌کردیم تا حساسیت به وجود نیاید.» برگزاری همه‌پرسی اگرچه براساس اصل ۵۹ قانون اساسی با رای مثبت دو سوم نمایندگان مجلس قابل اجراست، اما با تغییراتی که در سال ۱۳۶۸ در قانون اساسی به وجود آمد، این امر در زمره اختیارات رهبر قرار گرفت.